L'intervento può essere eseguito simultaneamente o un occhio alla volta.
I vantaggi e gli svantaggi sono i seguenti:

Vantaggi
Operando ambedue gli occhi nello stesso giorno, si fa una sola seduta chirurgica; il paziente ha un solo stress chirurgico ed emotivo; invece, quando si opera prima un occhio e dopo alcuni giorni l'altro, occorrono due sedute chirurgiche ed il paziente è sottoposto a due stress operatori.
Con l'intervento bilaterale simultaneo, dopo l'intervento, i due occhi recuperano la vista insieme, per cui sono più equilibrati; hanno inoltre la stessa qualità di vista e migliorano insieme; il paziente, inoltre, si adatta più rapidamente alla nuova situazione; per lo più, l'intervento fornisce un risultato più simile nei due occhi perchè le condizioni chirurgiche ed ambientali sono uguali.
Inoltre, da un punto di vista generale,l'intervento simultaneo comporta minor dispersione di tempo e di energia; ciò è importante per chi lavora, studia o per chi, non abitando nella città ove viene eseguito l'intervento, deve viaggiare e stare fuori casa.
Nei giorni successivi, i due occhi seguono la stessa cura e vengono controllati insieme, quindi, ci sono meno visite. Operando prima un occhio e successivamente l'altro, si ha il tempo di valutare il risultato ottenuto con il primo intervento e di programmare eventuali modifiche con il secondo intervento; nel periodo che intercorre fra un intervento e l'altro, l'occhio operato vede in modo diverso (bene) e, quello non operato, in maniera diversa (male) e questo può essere causa di parecchi disagi; l'occhio non operato è in difficoltà anche perchè non può usare la lente a contatto (in previsione dell'intervento) e perchè l'occhiale non viene tollerato (per la differenza fra un occhio e l'altro).
Inoltre, operando prima un occhio, lasciando qualche giorno di intervallo, e poi operando l'altro, si perdono alcuni giorni in più.

Svantaggi
In ogni intervento di qualunque tipo, eseguito sul corpo umano, una delle possibili complicanze è l'infezione; sebbene, nella chirurgia laser della cornea, il rischio di infezione grave sia estremamente raro, con l'intervento contemporaneo nei due occhi, c'è la possibilità che l'infezione colpisca ambedue gli occhi; (mentre, nel caso di intervento in un solo occhio, il rischio di infezione riguarda solo l'occhio interessato).
Una grave infezione può comportare serie ripercussioni sulla cornea, tali da ridurre drasticamente l'acuità visiva ed in casi estremamente rari compromettere, in maniera totale, la vista.
In conclusione, l'intervento simultaneo nei due occhi offre un recupero visivo globale più rapido e, nell'insieme, più comodo ma, in caso di problemi, essi possono interessare ambedue gli occhi.